不僅僅污水處理需要補充外來碳源，在魚塘亞鹽太高時，也會考慮通過補充碳源的方式來降低。
氨在轉化為硝酸鹽時的中間產物叫亞鹽，這種物質對魚蝦毒性很大，在氧氣充分、水體中N積累不是過多的情況下，亞鹽很容易轉化為硝酸鹽。
1.通過補充外來碳源，能夠促進浮游植物對氨氮的吸收，促進亞鹽的轉化，同時提同藻類的豐富度。
2.碳源的添加還能夠加速微生物絮凝團的絮凝，消耗氨氮，促進亞鹽的轉化。
3.碳源可以提高微生物的新陳代謝能力，提高其綜合作用。
補充碳源和微量元素可以促進藻類生長，提高藻類品種，從而降低水中亞鹽的含量。